正常人体通过免疫系统的应答反应来对抗外界的各种感染或刺激，从而达到保护机体的目的，但是系统性红斑狼疮的患者，免疫功能发生紊乱，针对自身组织产生“自身抗体”，造成自身组织的损害，并进一步诱导其他免疫细胞加入，导致全身炎症和血管病变，体内细胞在清理衰老和被破坏细胞的过程可能也受到损伤，从而进一步加重免疫系统的损害。

    为什么有些人会出现系统性红斑狼疮，而有些人不会患病(7系统性红斑狼疮的发生是一个复杂机制，与多种因素有关，包括基因易感性、免疫调节系统紊乱、性激素、环境因素等，其中环境因素起了重要作用。狼疮通常是外界因素和内在 因素共同作用的结果：特定的易感人群（种族、基因、免疫紊乱、性激素水平等），在一定的环境因素（如感染、饮食、毒素/药物、紫外线、化学因素等）下引起炎症、诱导细胞凋亡、造成组织损伤，最终导致系统性红斑狼疮发生。因为每个人的遗传素质不同，所处环境不同，所以每个患者的临床表现也轻重不一。故系统性红斑狼疮会出现多样性表现，及复发和缓解交替现象。