蛋白质在肠道内消化过程中，总有一部分未被消化的蛋白质和未被吸收的氨基酸在肠道下部受肠道细菌的作用，产生一些对人体有害的物质，如酚类、胺类、氨、硫化氢、甲烷、吲哚等，大部分要经过肠道排出体外。其中代谢产物氨及胺类物质要经过肝、肾解毒后，以无毒形式排出体外，所以摄入过量蛋白质会增加肝、肾的负担，对肝、肾造成损害。
