关键字：遗传风险基因，CKD，炎症，上皮生物学，网络

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简介： 摘要
全基因组关联研究（GWASs）已经确定了与CKD风险相关的多个基因座。几乎所有风险变异都定位于基因组的非编码区域;因此，这些变异在CKD发展中的作用在很大程度上是未知的。我们假设多态性改变了转录因子的结合，从而影响了附近基因的表达。在这里，我们检测了对照和患病人类肾脏样本中CKD相关多态性附近的转录本的调控，并使用系统生物学方法来鉴定潜在的因果基因。确定优先顺序。我们使用来自95个显微切割对照和患病小管样品和51个肾小球样品的RNA测序和基因表达阵列，在44个单核苷酸多态性附近插入226个转录物的表达和调节。来自41个小管样品的基因表达分析用于外部验证。小管室中的92个转录物和肾小球中的34个转录物显示出与eGFR的统计学显着相关性。鉴定了许多新基因，包括ACSM2A / 2B，FAM47E和PLXDC1。我们观察到在任何单个CKD风险等位基因附近的多个基因的表达与肾功能相关，可能表明遗传变异影响多个转录物.GFR相关转录物的网络分析突出了两个主要的簇;与上皮和血管功能呈正相关，与炎症基因簇呈负相关。总之，我们的功能基因组学分析突出了与肾功能相关的新基因和关键途径，以供将来分析。