整合基因组学识别黑人NEPTUNE受试者中与APOL1风险基因型的新关联(英文)
发布时间:2019-03-11 15:19:15    浏览量: 523
关键字:基因组学,黑人,NEPTUNE受试者,APOL1风险,基因型,新关联
简介: 摘要
APOL1变体与黑人的肾表型有关。为了改善临床结果并发现APOL1相关肾损伤的机制,我们分析了来自肾病综合症研究网络(NEPTUNE)中90名黑人受试者的临床和基因组数据集,按APOL1风险基因型分层。 90例蛋白尿≥0.5g/ d的受试者参加了原发性肾病综合征的第一次活检并随访。确定了临床结果,并进行了肾脏组织形态学测量和孟德尔肾病综合征基因测序.APOL1变异基因型,肾小球和肾小管间质分析来自方案肾活检核心的转录物的差异和相关基因表达。在隐性模型(由两个风险等位基因定义的高风险基因型)下进行分析。 APOL1高风险基因型与每1.73平方米低eGFR 17 ml / min显着相关,并且在任何时间完全缓解的概率降低69%,与组织学诊断无关。 APOL1风险组都没有为孟德尔突变而富集。在肾活检中,高风险基因型与增加的分数间质区域,间质纤维化和肾小管萎缩相关。风险基因型与肾内APOL1 mRNA表达水平无关。差异表达分析表明,与高风险基因型(肾小球中的CXCL9,CXCL11和UBD;肾小管间质中的SNOR14B和MUC13)相关的5个基因的稳态水平增加.APOL1管肠炎细胞间共表达分析显示共表达APOL1mRNA水平与一组肾内转录物一起与间质纤维化和肾小管萎缩增加有关。这些数据表明,高风险的APOL1基因型在组织病理学诊断中具有肾脏风险。
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