关键字：遗传学，查询病例组，单基因肾病综合征，诊断

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简介： 摘要
为了最大化肾病综合征（NS）患者的遗传筛查诊断单基因原因的临床益处，可靠地区分NS引起的变异与所有基因组中普遍存在的罕见，非因果变异的背景是至关重要的。为了确定北美病例队列中单基因NS的患病率，同时考虑遗传变异的背景流行，我们对来自肾病综合征研究网络的312名参与者和来自1000基因组计划（1000G）的61名参与对照的21个牵连单基因NS基因进行了测序。这些分析扩展到来自1000G的约2500名受试者的可用序列数据。典型的致病性过滤器确定了4.2％的患者和来自1000G的5.8％的受试者的NS的因果变异。我们设计了一种更严格的致病性过滤策略，将因果变异的背景患病率降低至1.5％。当将这种严格的过滤器应用于患者时，单基因NS的患病率为2.9％;在这些患者中，67％是儿科，44％有FSGS进行活检。完全缓解率与单基因分类无关。因此，我们确定了导致NS不准确的单基因分类的因素，并制定了更准确的变异过滤策略。在该偶发性受影响的群组中，单基因NS的患病率和临床相关性与针对遗传分析的患者的报告显着不同。特别是在未选择的基于人群的病例中，从概率而非确定性的角度考虑已知NS基因的假定因果变异可能更精确。我们还介绍了GeneVetter，一种用于罕见疾病单基因评估的网络工具。